Mostrar el registro sencillo del ítem

dc.contributor.advisorRodríguez, Kewin Jair
dc.contributor.advisorHernández Rojas, Edith del Carmen
dc.contributor.authorHernández Bermúdez, Luisa Fernanda
dc.date.accessioned2022-10-18T14:31:59Z
dc.date.available2022-10-18T14:31:59Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/5710
dc.description.abstractLa malaria ha sido descrita por la OMS como una de las enfermedades tropicales de mayor importancia en salud publica debido a las cifras de mortalidad y morbilidad que presentan en su mayor parte en zonas donde los determinantes de salud son precarios, esto debido a las dificultades encontradas para su control y eliminación. La existencia de un tratamiento profiláctico se hace cada vez más necesario para mitigar los efectos de esta afección representando así un reto para la comunidad científica, por esta razón se han diseñado nuevas estrategias para hallar proteínas candidatas a vacuna contra la malaria. En este proyecto se evaluó la antigenicidad y capacidad de unión a Complejo Mayor de Histocompatibilidad H2- IEd de péptidos derivados de regiones conservadas de la proteína AMA – 1 de Plasmodium yoelii, adicionalmente mediante herramientas bioinformáticas se diseñaron 6 constructos de péptidos quiméricos con alta unión a H2-IEd que permiten ser utilizados como objeto de estudio para la determinación de la respuesta inmune presentada en modelo murino. Los resultados obtenidos nos permiten garantizar la metodología y su aplicabilidad para la evaluación in vitro de péptidos y la optimización in silico de constructos que representen importancia en el desarrollo de un tratamiento profiláctico peptídico ante esta u otra enfermedadspa
dc.description.tableofcontentsRESUMEN..9 1. INTRODUCCIÓN....9 2. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA.13 2.1. Pregunta problema ......15 3. OBJETIVOS......15 3.1. General.15 3.2. Específicos..16 3.2.1. Determinar la antigenicidad de péptidos derivados de regiones conservadas de la proteína AMA – 1 de Plasmodium yoelii. ...16 3.2.2. Seleccionar péptidos derivados de regiones conservadas de la proteína AMA1 de Plasmodium yoelii dependientes de su unión a moléculas H2-IEd 16 3.2.3. Diseñar y seleccionar in silico péptidos quiméricos con capacidad de unión a H2-IEd . 16 4. ANTECEDENTES .16 5. MARCO REFERENCIAL 18 5.1. Malaria .18 5.1.1. Ciclo de vida.20 5.2. Epidemiología ..21 5.3. Malaria murina.23 5.3.1. Plasmodium yoelii 24 5.3.2. Cultivo celular .....24 5.4. Aspectos éticos.25 5.4.1. Normativa de manejo animal..25 6. DISEÑO METODOLÓGICO ..25 6.1. Universo, población, muestra ...25 6.1.1. Población de estudio...26 6.1.2. Muestra 26 6.2. Justificación 26 6.2.2. Hipótesis...29 7. METODOLOGÍA...29 7.2. Infección de ratones con Plasmodium yoelii 17XNL ...30 7.2.1. Parasitemia e histología .....31 1.1. Evaluación de antigenicidad de péptidos derivados de PyAMA-1.31 7.3. Cultivo de Plasmodium yoelii 17XNL....32 7.3.1. Cultivo celular .....32 7.4. Evaluación de reconocimiento específico de molécula H2-IEd por anticuerpo producido in vitro ..34 7.4.1. Purificación de moléculas H2-IEd .....34 7.5. Cuantificación de moléculas H2 - IEd36 7.6. Perfil de unión de péptidos a moléculas H2-IEd 36 7.7. Diseño y optimización de péptidos quiméricos para anclaje a moléculas H2-IEd.37 8. RESULTADOS .37 8.1. Curso de la infección por Plasmodium yoelii en modelo murino.38 8.2. Infección in vitro de GRs murinos con P. yoelii41 8.3. Evaluación de antigenicidad presentada por cada péptido derivado de regiones conservadas de la proteína AMA-1 de Plasmodium yoelii..42 8.4. Evaluación de capacidad de unión a CMH H2-IEd...45 8.4.1. Evaluación de identidad del H2 – IEd obtenido.....47 8.4.2. Cuantificación CMH 49 8.5. Constructos diseñados in silico con alta unión a H2-IEd 52 9. Discusión 59 10. CONCLUSIONES...65 BIBLIOGRAFÍA67spa
dc.format.extent71p.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.rightsDerechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2022spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/spa
dc.titlePtimización de péptidos quiméricos derivados del antígeno ama – 1 de Plasmodium yoelii, para el anclaje a moléculas h2-ied en modelo murino.spa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínicospa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias de la Saludspa
dc.publisher.placeBogotáspa
dc.publisher.programBacteriología y Laboratorio Clínicospa
dc.relation.referencesOPS, OMS. Guía para atención clínica integral del paciente con malaria. Bogotá: Ministerio de la Protección Social. 2010spa
dc.relation.referencesOrganization WH. World malaria report 2021. 2021spa
dc.relation.referencesOrganization WH. World malaria report 2020: 20 years of global progress and challenges. 2020.spa
dc.relation.referencesPérez DAM. Determinación del proteoma de la cepa vcg-1 de plasmodium vivax y caracterización de moléculas candidatas para su inclusión en el desarrollo de una vacuna: Universidad de Salamanca; 2017.spa
dc.relation.referencesPrieto P. Comités de ética en investigación con seres humanos: relevancia actual en Colombia Experiencia de la Fundación Santa Fe de Bogotá. Acta Médica Colombiana. 2011;36(2):98-104spa
dc.relation.referencesGonzález I. Inmunidad a la malaria letal en modelos murinos: adquisición espontánea o mediada por tratamiento quimioterapéutico. 2013.spa
dc.relation.referencesStevenson M, Riley E. Innate immunity to malaria. Nature Reviews Immunology. 2004;4(3):169-80spa
dc.relation.referencesRojas W, Anaya J, Cano L, Aristizábal B, Gómez L, Lopera D. Inmunología de Rojas: CIB Fondo Editorial; 2007spa
dc.relation.referencesTobón-Castaño A. Acciones necesarias para la eliminación de la malaria en Colombia. Revista Ciencias de la Salud. 2020;18(3):1-3spa
dc.relation.referencesAlonso P. Vacunas contra la malariaspa
dc.relation.referencesGoodman A, Forbes E, Williams A, Douglas A, de Cassan S, Bauza K, et al. The utility of Plasmodium berghei as a rodent model for anti-merozoite malaria vaccine assessment. Scientific reports. 2013;3(1):1-13.spa
dc.relation.referencesDraper S, Sack B, King C, Nielsen C, Rayner J, Seder R, et al. Malaria vaccines: recent advances and new horizons. Cell host & microbe. 2018;24(1):43-56.spa
dc.relation.referencesTubo N, Pagán A, Taylor J, Nelson R, Linehan J, Ertelt J, et al. Single naive CD4+ T cells from a diverse repertoire produce different effector cell types during infection. Cell. 2013;153(4):785-96.spa
dc.relation.referencesCarvalho L, Oliveira S, Alves F, Brígido M, Muniz J, Daniel-Ribeiro C. Aotus infulatus monkey is susceptible to Plasmodium falciparum infection and may constitute an alternative experimental model for malaria. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. 2000;95(3):363-5.spa
dc.relation.referencesNardin E. The past decade in malaria synthetic peptide vaccine clinical trials. Human vaccines. 2010;6(1):27-38.spa
dc.relation.referencesFenton B, Clark J, Khan C, Robinson J, Walliker D, Ridley R, et al. Structural and antigenic polymorphism of the 35-to 48-kilodalton merozoite surface antigen (MSA-2) of the malaria parasite Plasmodium falciparum. Molecular and cellular biology. 1991;11(2):963-71spa
dc.relation.referencesParker M, Penarete-Vargas DM, Hamilton P, Guérin A, Dubey J, Perlman S, et al. Dissecting the interface between apicomplexan parasite and host cell: Insights from a divergent AMA–RON2 pair. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2016;113(2):398-403spa
dc.relation.referencesTyler J, Treeck M, Boothroyd J. Focus on the ringleader: the role of AMA1 in apicomplexan invasion and replication. Trends in parasitology. 2011;27(9):410-20.spa
dc.relation.referencesMitchell G, Thomas A, Margos G, Dluzewski A, Bannister L. Apical membrane antigen 1, a major malaria vaccine candidate, mediates the close attachment of invasive merozoites to host red blood cells. Infection and immunity. 2004;72(1):154-8spa
dc.relation.referencesYang A, Lopaticki S, O'Neill M, Erickson S, Douglas D, Kneteman N, et al. AMA1 and MAEBL are important for Plasmodium falciparum sporozoite infection of the liver. Cellular microbiology. 2017;19(9):e12745.spa
dc.relation.referencesFraser T, Kappe S, Narum D, VanBuskirk K, Adams J. Erythrocyte-binding activity of Plasmodium yoelii apical membrane antigen-1 expressed on the surface of transfected COS-7 cells. Molecular and biochemical parasitology. 2001;117(1):49-59.spa
dc.relation.referencesNarum D, Ogun S, Thomas A, Holder A. Immunization with parasite-derived apical membrane antigen 1 or passive immunization with a specific monoclonal antibody protects BALB/c mice against lethal Plasmodium yoelii yoelii YM blood-stage infection. Infection and immunity. 2000;68(5):2899-906.spa
dc.relation.referencesMillares J. La vacuna contra la malaria: un gran desafío para la humanidadspa
dc.relation.referencesSrinivasan P, Ekanem E, Diouf A, Tonkin M, Miura K, Boulanger M, et al. Immunization with a functional protein complex required for erythrocyte invasion protects against lethal malaria. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2014;111(28):10311-6spa
dc.relation.referencesNeafsey D, Juraska M, Bedford T, Benkeser D, Valim C, Griggs A, et al. Genetic diversity and protective efficacy of the RTS, S/AS01 malaria vaccine. New England Journal of Medicine. 2015;373(21):2025-37.spa
dc.relation.referencesDennison S, Reichartz M, Abraha M, Spreng R, Wille-Reece U, Dutta S, et al., editors. Magnitude, Specificity, and Avidity of Sporozoite-Specific Antibodies Associate With Protection Status and Distinguish Among RTS, S/AS01 Dose Regimens. Open Forum Infectious Diseases; 2021: Oxford University Press US.spa
dc.relation.referencesOuattara A, Niangaly A, Adams M, Coulibaly D, Kone A, Traore K, et al. Epitopebased sieve analysis of Plasmodium falciparum sequences from a FMP2. 1/AS02A vaccine trial is consistent with differential vaccine efficacy against immunologically relevant AMA1 variants. Vaccine. 2020;38(35):5700-6spa
dc.relation.referencesPérez M. Diseño y síntesis de péptidos para el diagnóstico de la infección por el virus de la hepatitis G (GBV-C/HGV): Universitat de Barcelona; 2007.spa
dc.relation.referencesMarussig M, Rénia L, Motard A, Miltgen F, Pétour P, Chauhan V, et al. Linear and multiple antigen peptides containing defined T and B epitopes of the Plasmodium yoelii circumsporozoite protein: antibody-mediated protection and boosting by sporozoite infection. International immunology. 1997;9(12):1817-24.spa
dc.relation.referencesLeiton J, Montoya J, Villaroel M, Mondragón E. Influencia de la fuerza de infección y la transmisión vertical en la malaria: Modelado Matemático. Revista Facultad de Ciencias Básicas. 2017;13(1):4-18spa
dc.relation.referencesOchoa J, Osorio L. Epidemiology of urban malaria in Quibdo, Choco. Biomedica. 2006;26(2):278-85spa
dc.relation.referencesOspina M, Mancel E, Pacheco O, Quijada H. Enfermedades trasmitidas por vectores. Malaria. Boletín Epidemiológico Semanal. 2015;52:35-9.spa
dc.relation.referencesKhanam S, Sharma S, Pathak S. Lethal and nonlethal murine malarial infections differentially affect apoptosis, proliferation, and CD 8 expression on thymic T cells. Parasite immunology. 2015;37(7):349-61.spa
dc.relation.referencesVale N, Aguiar L, Gomes P. Antimicrobial peptides: a new class of antimalarial drugs? Frontiers in Pharmacology. 2014;5:275spa
dc.relation.referencesSalud INd. Boletín epidemiológico semana 11. ins.gov.co: Instituto Nacional de Salud; 2022 [spa
dc.relation.referencesDelgado J, Flores L, Chico M. Malaria importada en países no endémicos de las Américas, factores predisponentes 2013–2017. Boletín de Malariología y Salud Ambiental. 2021;61:52spa
dc.relation.referencesGranda S, Jiménez M. Paludismo: El desarrollo de una vacuna. Control Calid SEIMC. 2005:1-10.spa
dc.relation.referencesHuang B, Pearman E, Kim C. Mouse models of uncomplicated and fatal malaria. Bioprotocol. 2015;5(13).spa
dc.relation.referencesKillick-Kendrick R. Rodent malaria: Elsevier; 2012.spa
dc.relation.referencesTaylor-Robinson A. Regulation of immunity to Plasmodium: implications from mouse models for blood stage malaria vaccine design. Experimental parasitology. 2010;126(3):406-14.spa
dc.relation.referencesBoundenga L, Ngoubangoye B, Ntie S, Moukodoum N, Renaud F, Rougeron V, et al. Rodent malaria in Gabon: diversity and host range. International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife. 2019;10:117-24spa
dc.relation.referencesVasquez G, Patiño E, Garcia L, Barrera L. Los antigenos del complejo mayor de histocompatibilidad clase II: regulacion y relacion con infecciones intracelulares. Acta méd colomb. 2001:73-81.spa
dc.relation.referencesGardner M, Hall N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman R, et al. Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum. Nature. 2002;419(6906):498-511spa
dc.relation.referencesOliva S. La malaria y la controversia sobre su vacuna. Offarm: farmacia y sociedad. 2001;20(4):140-3.spa
dc.relation.referencesOlotu A, Fegan G, Wambua J, Nyangweso G, Awuondo K, Leach A, et al. Four-year efficacy of RTS, S/AS01E and its interaction with malaria exposure. New England Journal of Medicine. 2013;368(12):1111-20.spa
dc.relation.referencesReyes C, Molina-Franky J, Aza-Conde J, Suárez C, Pabón L, Moreno-Vranich A, et al. Malaria: Paving the way to developing peptide-based vaccines against invasion in infectious diseases. Biochemical and biophysical research communications. 2020;527(4):1021-6.spa
dc.relation.referencesMoisa A, Kolesanova E. Synthetic peptide vaccines. Insight and Control of Infectious Disease in Global Scenario. 2012:201-28.spa
dc.relation.referencesYepes-Pérez Y, López C, Suárez CF, Patarroyo MA. Plasmodium vivax Pv 12 B-cell epitopes and HLA-DRβ1*-dependent T-cell epitopes in vitro antigenicity. PloS one. 2018;13(9):e0203715.spa
dc.relation.referencesJensen KK, Andreatta M, Marcatili P, Buus S, Greenbaum JA, Yan Z, et al. Improved methods for predicting peptide binding affinity to MHC class II molecules. Immunology. 2018;154(3):394-406.spa
dc.relation.referencesReynisson B, Barra C, Kaabinejadian S, Hildebrand WH, Peters B, Nielsen M. Improved prediction of MHC II antigen presentation through integration and motif deconvolution of mass spectrometry MHC eluted ligand data. Journal of proteome research Immunology. 2020;19(6):2304-15.spa
dc.relation.referencesLivingston B, Crimi C, Newman M, Higashimoto Y, Appella E, Sidney J, et al. A rational strategy to design multiepitope immunogens based on multiple Th lymphocyte epitopes. The Journal of Immunology. 2002;168(11):5499-506.spa
dc.relation.referencesGiguère S, Drouin A, Lacoste A, Marchand M, Corbeil J, Laviolette F. MHC-NP: predicting peptides naturally processed by the MHC. Journal of immunological methods. 2013;400:30-6spa
dc.relation.referencesDrozdetskiy A, Cole C, Procter J, Barton GJ. JPred4: a protein secondary structure prediction server. Nucleic acids research. 2015;43(W1):W389-W94.spa
dc.relation.referencesLacerda-Queiroz N, Riteau N, Eastman R, Bock K, Orandle M, Moore I, et al. Mechanism of splenic cell death and host mortality in a Plasmodium yoelii malaria model. Scientific reports. 2017;7(1):1-12spa
dc.relation.referencesLesmes L, Gallego G, Carreño L, Hoebecke J, Lozano J. Actividad funcional de anticuerpos inducidos por péptidos-miméticos derivados del antígeno msp-2 del plasmodium, como potenciales agentes inmunoterapéuticos en malaria causada por plasmodium yoelii y plasmodium berghei en ratonres balb/c. Revista Colombiana de Ciencias Químico Farmacéuticas. 2011.spa
dc.relation.referencesMartinez C. Estudio comparativo y evaluacion del impacto de la cloroquina en muestras de ratones infectados con Plasmodium berghei, Plasmodium yoelii y Plasmodium vinckei; según la produccion de derivados hematimetricos. 2004.spa
dc.relation.referencesLanghorne J, Quin S, Sanni L. Mouse models of blood-stage malaria infections: immune responses and cytokines involved in protection and pathology. Chem Immunol. 2002;80(80):204-28.spa
dc.relation.referencesDeharo E, Gautret P, Mufioz V, Sauvain M. Técnicas de laboratorio para la selección de sustancias antimalaricas. Biblioteca virtual em saúde. 2000.spa
dc.relation.referencesDeharo E, Gautret P, Mufioz V, Sauvain M. Técnicas de laboratorio para la selección de sustancias antimalaricas. Biblioteca virtual em saúde. 2000.spa
dc.relation.referencesCarlton J, Angiuoli S, Suh B, Kooij T, Pertea M, Silva J, et al. Genome sequence and comparative analysis of the model rodent malaria parasite Plasmodium yoelii yoelii. Nature. 2002;419(6906):512-9.spa
dc.relation.referencesTaylor H, Triglia T, Thompson J, Sajid M, Fowler R, Wickham M, et al. Plasmodium falciparum homologue of the genes for Plasmodium vivax and Plasmodium yoelii adhesive proteins, which is transcribed but not translated. Infection and immunity. 2001;69(6):3635- 45.spa
dc.relation.referencesFu Y, Ding Y, Zhou T, Ou Q, Xu W. Comparative histopathology of mice infected with the 17XL and 17XNL strains of Plasmodium yoelii. Journal of Parasitology. 2012;98(2):310-5.spa
dc.relation.referencesPeng Y, Qi Y, Zhang C, Yao X, Wu J, Pattaradilokrat S, et al. Plasmodium yoelii erythrocyte-binding-like protein modulates host cell membrane structure, immunity, and disease severity. MBio. 2020;11(1):e02995-19spa
dc.relation.referencesObando‐Martinez A, Curtidor H, Vanegas M, Arévalo‐Pinzón G, Patarroyo M, Patarroyo M. Conserved regions from Plasmodium falciparum MSP11 specifically interact with host cells and have a potential role during merozoite invasion of red blood cells. Journal of cellular biochemistry. 2010;110(4):882-92spa
dc.relation.referencesPatarroyo M, Bermúdez A, Alba M, Vanegas M, Moreno-Vranich A, Poloche L, et al. IMPIPS: The Immune Protection-Inducing Protein Structure Concept in the Search for Steric-Electron and Topochemical Principles for Complete Fully-Protective Chemically Synthesised Vaccine Development. PLoS One. 2015;10(4):e0123249.spa
dc.relation.referencesRodriguez L, Jaimes R. Evaluación de la antigenicidad de péptidos derivados de la proteína pv12 de Plasmodium Vivax en muestras obtenidas de individuos de zonas endémicas de Colombia. 2018spa
dc.relation.referencesKindt T, Goldsby R, Osborne B. Inmunología de Kuby: McGraw Hill; 2007spa
dc.relation.referencesDe Jesús R, Torres E. Evaluación de factores de reproducción para detectar posible contaminación genética en cepas consanguíneas de ratones. J Bol Mal Salud Amb. 2006;46(2).spa
dc.relation.referencesRodríguez J, Bernal P, Prieto S, Correa C. Teoría de péptidos de alta unión de malaria al glóbulo rojo: predicciones teóricas de nuevos péptidos de unión y mutaciones teóricas predictivas de aminoácidos críticos. Inmunología. 2010;29(1):7-19spa
dc.relation.referencesRodrigues-da-Silva R, Correa-Moreira D, Soares I, de-Luca P, Totino P, Morgado F, et al. Immunogenicity of synthetic peptide constructs based on PvMSP9E795-A808, a linear B-cell epitope of the P. vivax merozoite surface protein-9. Vaccine. 2019;37(2):306-13.spa
dc.relation.referencesReynisson B, Alvarez B, Paul S, Peters B, Nielsen M. NetMHCpan-4.1 and NetMHCIIpan-4.0: improved predictions of MHC antigen presentation by concurrent motif deconvolution and integration of MS MHC eluted ligand data. Nucleic acids research. 2020;48(W1):W449-W54spa
dc.relation.referencesNielsen M, Lundegaard C, Blicher T, Peters B, Sette A, Justesen S, et al. Quantitative predictions of peptide binding to any HLA-DR molecule of known sequence: NetMHCIIpan. PLoS computational biology. 2008;4(7):e1000107.spa
dc.relation.referencesTourdot S, Oukka M, Manuguerra J, Magafa V, Vergnon I, Riche N, et al. Chimeric peptides: a new approach to enhancing the immunogenicity of peptides with low MHC class I affinity: application in antiviral vaccination. The Journal of Immunology. 1997;159(5):2391-8.spa
dc.relation.referencesFonseca J, Cabrera-Mora M, Singh B, Oliveira-Ferreira J, da Costa Lima-Junior J, Calvo-Calle J, et al. A chimeric protein-based malaria vaccine candidate induces robust T cell responses against Plasmodium vivax MSP119. Scientific reports. 2016;6(1):1-18.spa
dc.relation.referencesRodríguez J. Teoría de unión al HLA clase II: teoría de probabilidad, combinatoria y entropía aplicadas a secuencias peptídicas. Inmunología. 2008;27(4):151-66.spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)spa
dc.subject.proposalPlasmodiumspa
dc.subject.proposalcomplejo mayor de histocompatibilidadspa
dc.subject.proposalpéptidospa
dc.subject.proposalAMA-1spa
dc.subject.proposalbioinformáticaeng
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_14cbspa


Ficheros en el ítem

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)

Mostrar el registro sencillo del ítem

Derechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2022
Excepto si se señala otra cosa, la licencia del ítem se describe como Derechos Reservados - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2022