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Analisis de la presencia de los complejos enzimaticos Pksi, Pksii y Nrps por Pcr y/o enfrentamiento directo en actinobacterias aisladas del rio Arauca

dc.contributor.advisorDíaz Barrera, Luis Eduardo
dc.contributor.authorHernández Duarte, Dihana Estefanyha
dc.date.accessioned2021-11-10T19:24:35Z
dc.date.available2021-11-10T19:24:35Z
dc.date.issued2018-03
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/3637
dc.description.abstractEl hallazgo de nuevos compuestos microbianos y de metabolitos secundarios bioactivos sigue siendo importante en la investigación de nuevos medicamentos. Por lo cual, se requieren estrategias con el fin de aumentar la probabilidad de conocer nuevas sustancias y propiedades que disminuyan el tiempo de elaboración y el costo de los procesos tradicionales de identificación, en la producción de nuevos medicamentos. Así entonces, se planteó un estudio mediante la realización de una prueba de identificación molecular, como la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que permitió detectar a nivel molecular en Actinobacterias aisladas de la ribera del Río Arauca la presencia de algunos genes biosintéticos pertenecientes a los complejos Policétido sintasa tipo I: PKSI, Policétido sintasa tipo II: PKSII y Péptido sintasa no ribosómicos NRPS. Proceso en el cual se tomaron 30 cepas Pertenecientes a la Universidad de La Sabana, identificadas dentro del género Streptomyces, en las cuales gen que codifica para algunas enzimas de los complejos PKSI, PKSII y NRPS, fue amplificado en 18 cepas (60%); a diferencia de 12 (40%) cepas que no presentaron amplificación para los mismos genes; Se identificaron 6 cepas : 160 (Streptomyces sp), 326 (Streptomyces sp), 412 (Streptomyces sp parvulus ), 445 (Streptomyces sp), 627 (Streptomyces sp) y 270(Streptomyces sp ) con la presencia de los tres genes seleccionados, correspondientes a los complejos PKSI, PKSII y NRPS. Se realizó una evaluación de la actividad antimicrobiana por enfrentamiento directo o antagonismo donde se determinó una actividad antibactérial preferencialmente hacia bacterias Gram positivas del 67%, comparando estas evaluaciones con los resultados de la técnica de PCR, indicando que las cepas que no presentaron amplificación pero si tienen actividad antimicrobiana, pueden producir antibióticos mediante otros mecanismos diferentes al objeto de estudio de la presente investigación. Se concluye que la técnica de PCR disminuye los tiempos de evaluación de producción de metabolitos antibacteriales en cepas microbiológicas con una alta eficiencia y a bajos costos (frente a técnicas microbiológicas) aunque se debe ampliar el grupo de genes a evaluar a otros sistemas de síntesis de compuestos antibacteriales.spa
dc.description.tableofcontentsTABLA DE CONTENIDO 1 Introducción 1 2 Antecedentes 5 3 Marco teórico 9 3.1 Actinomicetes 9 3.2 Policétidos 10 3.3 Biosíntesis de policétidos y péptidos no ribosomales 11 3.3.1 Biosíntesis de policétidos tipo PKS I y PKS II 11 3.3.2 Biosíntesis de péptidos no ribosomales 16 4 OBJETIVOS 19 4.1 OBJETIVO GENERAL 19 4.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS 19 5 Diseño metodológico 20 5.1 Tipo de investigación 20 5.2 Población 20 5.3 Muestra 20 5.4 Hipótesis 20 5.5 Variables 21 5.6 Técnicas y procedimientos 22 5.6.1 Activación de actinomicetos 22 5.6.2 Identificación morfológica 23 5.6.3 Actividad antimicrobiana 23 5.6.4 Extracción de ADN 24 5.6.4.1 5.6.4.1 Amplificación del gen 16S rRNA 25 5.6.4.2 5.6.4.2 Identificación y presencia de genes mediante PCR 26 5.6.4.3. Secuenciación 28 6 Análisis estadístico 28 7 Resultados 28 7.1 . Cultivos 29 7.1.1. Activación de actinomicetos 29 7.1.2 Identificación morfológica 31 7.1.2.1 Características Macroscópicas 31 7.1.2.2 Características Microscópicas 32 7.1.3 Actividad antimicrobiana 33 7.2 Interpretación de datos por técnica de enfrentamiento directo 35 8 Identificación Molecular 36 8.1 Extracción de ADN 36 8.2 Amplificación del gen 16S rRNA 37 8.3 Resultados de la técnica de PCR detección del gen PKSI, PKSII Y NRPS 39 8.3.1 Determinación de las concentraciones para la técnica de PCR 39 8.3.2 Amplicones para los Genes PKSI, PKSII YNRPS 42 8.4 Interpretación de datos presencia de los genes PKSI, PKSII Y NRPS en PCR 46 9 Interpretación de resultados de las técnicas PCR y Enfrentamiento directo 48 9.1 Actividad antimicrobiana vs presencia de genes biosintéticos 48 10. Análisis estadístico 50 10 Discusión 51 12 Conclusiones 61 Referencias bibliográficas 63spa
dc.format.extent68p.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarcaspa
dc.rightsUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/spa
dc.titleAnalisis de la presencia de los complejos enzimaticos Pksi, Pksii y Nrps por Pcr y/o enfrentamiento directo en actinobacterias aisladas del rio Araucaspa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameConstructor(a) y Gestor(a) en Arquitecturaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ingeniería y Arquitecturaspa
dc.publisher.placeBogotá D.Cspa
dc.publisher.programConstrucción y Gestión en Arquitectura Ciclo Profesionalspa
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dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)spa
dc.subject.lembCompuestos Microbianos
dc.subject.lembBioactivos
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