Evaluación del uso del glifosato sobre la microbiota del suelo, en la zona de amortiguación del parque nacional natural paramillo, en Córdoba, Colombia.

Abstract

El glifosato es un herbicida de amplio espectro utilizado para la erradicación de cultivos ilícitos y para el control de malezas en cultivos lícitos de importancia agrícola. En Colombia, en los últimos años, su uso ha tenido un gran auge, debido al incremento de cultivos de coca, marihuana y amapola, ocasionando variaciones en la microbiota presente en el suelo, de acuerdo con investigaciones previas. El objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto del uso de glifosato sobre la diversidad de poblaciones microbianas presentes en el suelo de la zona de amortiguación del parque Nacional Natural Paramillo, Córdoba, Colombia. La metodología incluyó la recolección de muestras de suelo de dos zonas diferentes del parque: suelo impactado con glifosato y suelo sin contacto previo con glifosato, para esto se tuvo en cuenta el formato de concepto técnico sobre daño ambiental emitido por el Parque Nacional Natural Paramillo. Se realizó extracción de ADN mediante el kit comercial ZymoBIOMICSTM DNA Miniprep, el cual fue analizado mediante la plataforma de secuenciación de segunda generación Illumina Mi Seq, a partir de las región 16S del rRNA de procariotas. Para el suelo con glifosato se obtuvieron 55414 secuencias crudas y 219 OTU y para el suelo sin glifosato se obtuvieron 56656 secuencias crudas y 405 OTUs, respecto a los parámetros taxonómicos predominantes se encontró: Filo Proteobacterias (30.8% y 34.9%), Clase Alphaproteobacteria (18.27% y 24.56%), Orden Rhizobiales (12.2% y 15.2%), Familia Xanthomonadaceae (2.9% y 0.0%), Género Acidothermus (4.2% y 4.5%) y finalmente Especie defluvii-equi-niigatensis (2.0% y 0.9%).

Glyphosate is a broad-spectrum herbicide used for the eradication of illicit crops and for the control of weeds in licit crops of agricultural importance. In Colombia, in recent years, its use has had a great boom, due to the increase in coca, marihuana and poppy crops, causing variations in the microbiota present in the soil, according to previous research. The objective of this work was to evaluate the effect of the use of glyphosate on the diversity of microbial populations present in the soil of the buffer zone of the Parque Nacional Natural Paramillo, Córdoba, Colombia. The methodology included the collection of soil samples from two different areas of the park: soil impacted with glyphosate and soil without previous contact with glyphosate, for this the format of the technical concept on environmental damage emitted by the Parque Nacional Natural Paramillo was taken into account. DNA extraction was carried out using the commercial kit ZymoBIOMICS TM DNA Miniprep, which was analyzed using the second generation sequencing platform Illumina Mi Seq, from the 16S region of prokaryotic rRNA. For the soil with glyphosate 55414 crude sequences and 219 OTU were obtained and for the soil without glyphosate 56656 crude sequences and 405 OTUs were obtained, with respect to the predominant taxonomic parameters found: Phylum Proteobacteria (30.8% and 34.9%), Class Alphaproteobacteria ( 18.27% and 24.56%), Order Rhizobiales (12.2% and 15.2%), Family Xanthomonadaceae (2.9% and 0.0%), Genus Acidothermus (4.2% and 4.5%) and finally Species defluvii-equi-niigatensis (2.0% and 0.9% ).