TY - THES 
TI - Búsqueda de regiones homólogas a péptidos antimicrobianos en el genoma de Solanum lycopersicum con acción frente a Ralstonia  solanacearum
AU - Cortés Hernández, Alexandra
AB - La marchitez bacteriana en cultivos de tomate (Solanum lycopersicum),
ocasionada por Ralstonia solanacearum, causante de grandes pérdidas en los
cultivos. Las plantas poseen un elaborado sistema inmune, no obstante, los
fitopatógenos buscan estrategias para evadir sus mecanismos de defensa y
lograr invadirlas, causando que los agricultores realicen una alta inversión
económica para su control.
El objetivo de este trabajo es la búsqueda de regiones homólogas a péptidos
antimicrobianos en el genoma de Solanum lycopersicum, que presenten un
potencial efecto contra Ralstonia solanacearum. Por medio de bases de datos
de Péptidos antimicrobianos (AMP) se eligieron tres péptidos tipo Defensinas
encontrados en Spinacia oleracea (D1, D2, D5), luego se realizó un alineamiento
de la secuencia de estos con 256 genes de Solanum lycopersicum, de los cuales
tres presentaron homología con D1, se compararon los alineamientos para hallar

las posiciones que presentaran cambios de aminoácidos. Por medio de I-
TASSER se generó el modelo de la estructura 3D de D1 y se graficaron siete

zonas con variaciones; las funciones de las posiciones afectadas fueron
estudiadas, considerando las propiedades de los aminoácidos y se analizó la

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secuencia de los péptidos homólogos en APD3, los resultados revelaron que los
péptidos corresponden a AMP tipo Defensinas, coincidiendo con D1, además,
los aminoácidos modificados compartieron características, por ende, se concluyó
que estas variaciones no afectarían la acción antimicrobiana de los péptidos
homólogos y presentarían un alto potencial para brindar una nueva estrategia de
control contra la marchitez bacteriana.
DA - 2019
KW - péptidos antimicrobianos
KW - defensinas
KW - marchitez bacteriana
KW - homología
KW - bioinformática
PB - Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca
UR - https://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/3605
ER -