Estudio del microbioma de Alphitobius diaperinus recolectado en una granja avícola mediante una aproximación metagenómica.

Abstract

Son varios los factores que afectan la salud de las aves en la producción avícola, sin embargo, se ha dedicado poca atención a los artrópodos que pueden actuar como posibles vectores de enfermedad, siendo el actor principal Alphitobius diaperinus. En respuesta a esta problemática, de lo que representa este artrópodo en avicultura, se plantearon dos enfoques: el primero basado en metagenómica por secuenciación no dirigida o shotgun, en el que se secuenció todo el material genómico y se realizó el correspondiente análisis bioinformático, que permitió conocer la diversidad y la abundancia de las comunidades microbianas; y el segundo, la determinación de las especies con potencial biotecnológico y de los posibles genes de resistencia antimicrobianos en las especies con riesgo de patogenicidad identificadas en el estudio. Este trabajo amplía el conocimiento sobre la comunidad microbiana de A. diaperinus en relación a su potencial en bioprospección, plantear una alerta a la comunidad médica, y los avicultores de los riesgos por la posible transferencia de genes de resistencia a los antibióticos. Además se proponen recomendaciones a los avicultores en relación al biomanejo de este artrópodo.

There are several factors that affect the health of birds in poultry production, however, little attention has been devoted to arthropods that can act as possible vectors of disease, the main actor being Alphitobius diaperinus. In response to this problem, of what this arthropod represents in poultry farming, two approaches were proposed: the first based on metagenomics by non- directed sequencing or shotgun, in which all the genomic material was sequenced and bioinformatic analysis was carried out, which allowed knowing the diversity and abundance of microbial communities; and the second, the determination of the species with biotechnological potential and the possible antimicrobial resistance genes in the species with risk of pathogenicity identified in the study. This work expands the knowledge about the microbial community of A. diaperinus in relation to its potential in bioprospecting, raising an alert to the medical community, and poultry farmers of the risks due to the possible transfer of antibiotic resistance genes. In addition, recommendations are proposed to poultry farmers in relation to the biomanagement of this arthropod.