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Estandarización de una herramienta molecular para la identificación y diferenciación de dos clones de Staphylococcus Aureus resistentes a Meticilina de genotipo comunitario (Sarmgc) de circulación en Colombia

dc.contributor.advisorCastro Cardozo, Betsy Esperanza
dc.contributor.advisorMuñoz, Liliana Constanza
dc.contributor.authorAnchico Godoy, James Alexander
dc.contributor.authorLaurens Hernández, Mario Alberto
dc.date.accessioned2021-12-06T19:58:07Z
dc.date.available2021-12-06T19:58:07Z
dc.date.issued2018-05-31
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicolmayor.edu.co/handle/unicolmayor/3771
dc.description.abstractStaphylococcus aureus resistentes a meticilina de genotipo comunitario (SARM-GC) son un grupo de aislamientos de gran importancia clínica y epidemiológica debido a su emergencia en el ambiente comunitario y rápida diseminación en ambientes hospitalarios, gracias a su gran capacidad de adquirir mecanismos de virulencia y resistencia a antibióticos por medio de material genético foráneo. En Colombia, desde las últimas décadas, se ha identificado el incremento de infecciones generadas por SARM-GC; asociados únicamente a los clones USA300- variante Latinoamericana (USA300-VL) y COL923. Estos clones difieren entre sí en sus características genéticas y moleculares, debido a la presencia de diferentes subtipos de SCCmec, variaciones en la estructura de islas genómicas, perfil de resistencia y virulencia. Lo cual hace necesario realizar una adecuada identificación y caracterización de estos clones, lo que permitirá entender mejor su patogénesis, frecuencia y dinámicas de diseminación. Por esta razón el presente trabajo tuvo como objetivo estandarizar una PCR múltiple como herramienta para la identificación y diferenciación de aislamientos pertenecientes a los clones USA 300VL y COL923 de circulación nacional, en la cual se amplifican genes marcadores presentes en los elementos genéticos móviles de cada clon. Una vez estandarizado esta metodología se verificó su poder discriminatorio en una cohorte de 106 aislamientos provenientes de diferentes fuentes clínicas, previamente clasificadas como SARM-GC. Los resultados mostraron que si existen características moleculares que difieren a los clones USA 300VL y COL923 en la Isla de patogenicidad 5 de Staphylococcus aureus (SaPI5), Prografo 3 (ϕ3), Isla genómica beta y yqiL que permitieron su identificación y diferenciación por medio de PCR. Se logró identificar que el 68% de aislamientos, de los 12 evaluados en el estudio, se encuentran genéticamente relacionados con el clon USA 300VL; y que el 32% restante se asocian al clon COL923. Con los resultados obtenidos se pudo concluir que esta herramienta es rápida, menos costosa y dispendiosa a comparación de otras herramientas de identificación molecular tales como PFGE y MLST y que a su vez, brinda la posibilidad a que haya un mayor control epidemiológico de estos aislamientos teniendo en cuenta que tan variante es la epidemiologia de este microorganismo.spa
dc.description.tableofcontentsRESUMEN EJECUTIVO 11 1. INTRODUCCION 13 2. ANTECEDENTES 16 3. MARCO TEORICO 22 3.1. Generalidades de Staphylococcus aureus 22 3.2. Factores de patogenicidad y virulencia 23 3.3. Mecanismo de acción de los B- lactamicos 25 3.4. Mecanismo de resistencia a la meticilina 27 3.5. Clasificación de los aislamientos Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (SARM 28 3.6. Características moleculares de SARM. Tipo y subtipo de Casete Estafilocóccico Cromosomal SCCmec 31 3.7. Elementos genéticos móviles presentes en Staphylococcus aureus 33 3.7.1. Elemento móvil del catabolismo de la arginina (ACME).33 3.7.2. Islas de patogenicidad 34 3.7.3. Islas genómicas vSaα y vSaβ 37 3.8. Características moleculares asociadas al clon COL 923 y al clon USA300 VL 38 3.9. Epidemiologia de SARM en Colombia 44 4. PREGUNTA PROBLEMA 46 5. OBJETIVOS 47 5.1. Objetivo General 47 5.2. Objetivos específicos 47 6. METODOLOGIA 48 6.1. Tipo de estudio 48 6.2. Técnicas y procedimientos 50 6.2.1. Extracción y cuantificación de ADN 50 6.2.2. Descripción de los aislamientos 51 6.2.3. Amplificación de los elementos genéticos móviles de los aislamientos clínicos por PCR individual 52 6.2.4. Diseño de PCR múltiple 55 7. RESULTADOS 59 7.1. Caracterización de los aislamientos 59 7.1.1. Fuente de los aislamientos pertenecientes al estudio 59 7.1.2. Clasificación por resistencia a meticilina 60 7.2. Estandarización de PCR múltiple para la identificación de SARM-GC de circulación en Colombia 61 7.3. Condiciones para la digestión del gen Acetil coenzima A Acetil Transferasa (yqil 65 7.4. Evaluación de la frecuencia de los EGM en todos los aislamientos 67 7.5. Digestión del gen yqil 74 8. DISCUSION 76 9. CONCLUSIONES 80 ANEXOS 81 REFERENCIAS 83spa
dc.format.extent88p.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarcaspa
dc.rightsUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/spa
dc.titleEstandarización de una herramienta molecular para la identificación y diferenciación de dos clones de Staphylococcus Aureus resistentes a Meticilina de genotipo comunitario (Sarmgc) de circulación en Colombiaspa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínicospa
dc.identifier.barcode58417
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias de la Saludspa
dc.publisher.placeBogotá D.Cspa
dc.publisher.programBacteriología y Laboratorio Clínicospa
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dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)spa
dc.subject.lembAmbiente comunitario
dc.subject.lembAmbientes hospitalarios,
dc.subject.lembSARM-GC
dc.subject.lembIslas genómicas
dc.subject.proposalStaphylococcus aureusspa
dc.subject.proposalGenotipo comunitariospa
dc.subject.proposalResistencia a meticilinaspa
dc.subject.proposalReacción en cadena de la polimerasaspa
dc.subject.proposalGenotipo comunitariospa
dc.subject.proposalUSA300-VLspa
dc.subject.proposalCOL923spa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_14cbspa


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Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, 2018
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